"MENU3" cela ne me dit rien du tout.

La version de PhpWebGallery.
Un lien vers le site.
Une explication du besoin.

Des principes qui pourraient influencer notre réponse et surtout donner l'envie d'en apporter une précise et juste.

Pour l'instant, aucune idée de ce que tu cherches à faire.
8-)

Déplacer le bloc ça sera dans ./template/yoga/menubar.tpl
prendre d'un <dl> jusqu'à un </dl>

changer l'ordre ça sera pour cette release 1.6 (et encore la 1.7) dans ./include/menubar.inc.php
Entre
//---------------------------------------------------------- special categories
et
//--------------------------------------------------------------------- summary
voire même un peu après,
les liens sont clairement délimités par des commentaires.

8-)