En fait.. j'avais mal cherché... ça marche tout à fait.

Le code a peu changé, c'est juste le fichier qui est différent.
Il faut modifier functions.inc.php

Et remplacer :
    elseif ( isset( $upper_ids[ $category['id'] ] ) )
par
    elseif ( isset( $upper_ids[ $category['id'] ] ) or substr_count($category['global_rank'],'.')==0 )

Ceci dit maintenant que j'ai réussi à faire la modif... je ne suis plus certain de vouloir laisser comme ça ;)
En fait selon les catégories je voudrais développer ou pas... mais vu la nouvelle option "ne montrer que les catégories récentes" et vu que j'ai fait des liens vers les catégories que je veux mettre en avant, via PWG Stuffs et Extended description... l'utilité est devenue assez faible, en fait.