Perso, je ne sais pas, mais si les photos ont été envoyées par FTP dans le répertoire de la galerie, il est possible de les modifier sur ton ordi et de les ré-envoyer en écrasant les autres.

Sinon, potentiellement, il est peut être possible de faire cela en téléchargeant ton répertoire contenant les images uploadées via le système d'envoi et de les convertir puis de les ré-envoyer avec les même nom même répertoire, mais je ne sais pas si Piwigo accepterai cela ou s'il y a des précautions.